Welcome, Guest. Please Login or Register
UGENE Bulletin Board
  Welcome to our forum.
  HomeHelpSearchLoginRegister  
 
 
Page Index Toggle Pages: 1
Primer library (Read 2124 times)
Dec 3rd, 2014 at 10:53pm

Ilya Flyamer   Offline
Full Member

Gender: male
Posts: 126
***
 
Отличная идея с библиотекой праймеров, спасибо! Хотелось бы предложить несколько идей по ее улучшению.

1) Добавить поле "Комментарий" или "Детальное описание" для каждого праймера
2) Добавить поля "Матрица" (с возможностью привязки к конкретному файла последовательности, чтобы открывать его напрямую, а также подсвечивать праймеры там), "Координаты праймера на матрице", поле с выбором прямой/обратный. Удобно иметь возможность указать, какой праймер с этим составляет пару, а также последовательность и координаты в сиквенсе их ПЦР-продукта. Наверное, стоит отображать по умолчанию праймеры из одной пары рядом друг с другом тогда, и рядом информацию про их ПЦР-продукт.
3) Добавить или поле "Проект", или возможность объединять праймеры в "папки"
4) Добавить возможность создавать свои поля
4) Добавить возможность поиска по базе
5) Добавить возможность добавления в базу из интерфейса просмотра последовательностей напрямую, или как добавление аннотации, или как выделения (или и того, и того).

Получилось довольно много, но на мой взгляд все это сильно улучшит юзабилити этой замечательной фичи.
 
IP Logged
 
Reply #1 - Dec 27th, 2016 at 12:34am

Claire Ellison   Offline
YaBB Newbies

Posts: 5
*
 
These primers are designed for gene expression detection or quantification (real-time PCR). PrimerBank contains over 306,800 primers covering most known human and mouse genes. ... Xiaowei Wang, Athanasia Spandidos, Huajun Wang and Brian Seed:
 
IP Logged
 
Page Index Toggle Pages: 1