Welcome, Guest. Please Login or Register
UGENE Bulletin Board
  Welcome to our forum.
  HomeHelpSearchLoginRegister  
 
 
Page Index Toggle Pages: 1
Поиск сайтов рестрикции (Read 4604 times)
Aug 28th, 2015 at 9:37pm

Ilya Flyamer   Offline
Full Member

Gender: male
Posts: 126
***
 
Здравствуйте. Очень клево, что вся база REBASE  есть в юджин для поиска сайтов. Однако если надо найти хоть какие-нибудь рестриктазы, которые режут какую-то последовательность, то, при выборе всей базы, получается полный ужас - добавление аннотаций происходит очень долго, потому что ферментов так много. И основная фишка, что на каждый сайт рестрикции попадает очень много аннотаций ферментов, узнающих одинаковые сайты. Может, все "синонимичные" ферменты отмечать только один раз? И, может, каким-то образом сделать отдельную базу "часто используемых" ферментов, которые чаще всего можно найти в любой лаборатории? Второе, конечно, нетривиально...
 
IP Logged
 
Reply #1 - Sep 1st, 2015 at 4:04pm

Olga Golosova   Offline
YaBB Administrator

Posts: 265
*****
 
Илья, про группы я создала UGENE-4691.


Quote:
И, может, каким-то образом сделать отдельную базу "часто используемых" ферментов, которые чаще всего можно найти в любой лаборатории? Второе, конечно, нетривиально...

Вы пробовали сохранять энзимы в файл и загружать их оттуда? В диалоге есть соответствующие кнопки: "Save selection", "Load selection".
 
IP Logged
 
Reply #2 - Sep 6th, 2015 at 4:16pm

Ilya Flyamer   Offline
Full Member

Gender: male
Posts: 126
***
 
Спасибо, Ольга! Интересная мысль про сохранение, должно помочь.
 
IP Logged
 
Page Index Toggle Pages: 1