UGENE home page

Пакет внешних инструментов

Пакет содержит следующие программные продукты:

Windows Linux Mac OS X
32 bit 64 bit 32 bit 64 bit 32 bit 64 bit
download download download download download download
bedGraphToBigWig-4 + + +
bedtools2-2.20.1 + + + + + +
BLAST-2.2.26 + + + + + +
BLAST-2.2.28+ + + + + + +
Bowtie-1.0.0 + + + +
Bowtie2-2.1.0 + + + + +
Bowtie2-2.0.6 +
BWA-0.7.8 + + + + + +
CAP3 + + + + + +
ClustalO-1.2.0 + + + + + +
ClustalW-2.1 + + + + + +
MAFFT-7.045b + + + + + +
T-Coffee-9.03 + + + + + +
Mr.Bayes-3.2.1 + + + + + +
Spidey + + + + +
Conduct GO-1.0 + + + +
MDSeqPos-2.0 + + + +
Conservation Plot-0.1 + + + +
peak2gene-1.0.2 + + + +
MACS-1.4.2 + + + +
CEAS-0.9.9.7 + + + +
Cufflinks-2.0.2 + +
SAMtools-0.1.19 + + + + + +
Tophat-2.0.8 + +
Python-2.7.5 + + + + + +
Perl-5.10.0.5 + +
vcftools_0.1.11 + + + + + +
tabix + + + +
SPAdes 3.1.1 + +
snpEff 4.1b + + + + + +
FastQC 0.11.2 + + + + + +
cutadapt 1.7.1 + + + + + +
download download download download download download
32 bit 64 bit 32 bit 64 bit 32 bit 64 bit
Windows Linux Mac OS X

Чтобы начать использовать одну из указанных программ из UGENE, cкачайте пакет внешних инструментов, подходящий для вашей системы, разархивируйте его и пропишите путь к внешнему инструменту в настройках UGENE.

Более подробная инструкция доступна в разделе документации External Tools.