Скачать UGENE и компоненты
Текущая версия UGENE: 40.1 (Октябрь, 2021). См. краткое
описание новой версии.
Пакеты UGENE
Выберите пакет для вашей операционной системы:
- UGENE инсталлятор для Windows 64-бит
- Портативная версия UGENE для Windows 64-бит
- Портативная версия UGENE для Linux 64-бит
- UGENE инсталлятор для macOS
Референсные данные для NGS
Для некоторых видов анализа данных высокопроизводительного секвенирования (таксономической классификации и
ChIP-Seq) требуется наличие референсных данных (например, RefSeq-данные, таксономическая информация с NCBI и др.).
Рекомендуется использовать онлайн-инсталлятор для скачивания этих данных. Однако, можно также использовать ссылки
для скачивания ниже. При этом потребуется дополнительная конфигурация
установленного пакета. Убедитесь, что на компьютере достаточно дискового пространства.
Референсные данные для классификации метагеномных NGS-данных
- NCBI таксономическая информация
- Геномы бактерий с NCBI RefSeq
- Геномы вирусов с NCBI RefSeq
- Геном человека (GRCh38) с NCBI RefSeq
- База данных для Kraken: MiniKraken 4Gb
- База данных для CLARK-l: геномы бактерий и вирусов c RefSeq
- База данных для CLARK-l: геномы вирусов c RefSeq
- База данных для DIAMOND: UniRef50
- База данных для DIAMOND: UniRef90
- База данных для MetaPhlAn2: mpa_v20_m200
Референсные данные для анализа ChIP-Seq данных
Исходный код
UGENE является свободным программным обеспечением, распространяемым с лицензией GNU GPL v2. Исходный код доступен
на GitHub.
Старые пакеты UGENE
До версии UGENE 34 выпускались следующие типы пакетов:
- Полный: содержит базовые модули UGENE и внешние («external») инструменты (включая большинство инструментов для анализа данных высокопроизводительного секвенирования (NGS).
- NGS: предназначен для анализа ChIP-Seq данных.
Начиная с версии 34 поставляются по одному онлайн и одному офлайн пакету для 64-битных версий операционных систем
(см. выше).
Старые пакеты версии 33 доступны для скачивания ниже. Также доступны пакеты других версий для устаревших
операционных систем.
Windows
Помимо типов пакетов, указанных выше, для Windows поддерживается два способа поставки, не влияющих, однако, на
содержащиеся модули:
- Оффлайн-инсталлятор: предоставляет более полную интеграцию с операционной системой.
- Zip-архив: портативная версия программы, не требующая администраторских прав.
| ОС / платформа + тип поставки | Полный пакет | NGS пакет |
|---|---|---|
| Windows 7+ (64-бит) Оффлайн-инсталлятор |
Скачать вер.33 | Отсутствует |
| Windows 7+ (64-бит) Zip-архив |
Скачать вер.33 | Скачать вер.33 |
| Windows 7+ (32-бит) Оффлайн-инсталлятор |
Скачать вер.33 | Отсутствует |
| Windows 7+ (32-бит) Zip-архив |
Скачать вер.33 | Отсутствует |
| Windows XP/Vista (32-бит) Zip-архив |
Скачать вер.1.29 | Отсутствует |
Linux
На различных версиях Linux используйте универсальный пакет UGENE в виде TAR.GZ-архива.
| ОС / платформа + тип поставки | Полный пакет | NGS пакет |
|---|---|---|
| Linux (64-bit) TAR.GZ-архив |
Скачать вер.33 | Скачать вер.33 |
| Linux (32-bit) TAR.GZ-архив |
Скачать вер.33 | Отсутствует |
macOS
Для пользователей macOS UGENE поставляется в виде DMG-архива.
| ОС / платформа + тип поставки | Полный пакет | NGS пакет |
|---|---|---|
| macOS 10.7+ (64-бит) DMG-архив |
Скачать вер.33 | Скачать вер.33 |
| Mac OS X 10.6 (64-бит) DMG-архив |
Скачать вер.1.18.0 | Отсутствует |
| Mac OS X 10.5 (32-бит) DMG-архив |
Скачать вер.1.18.0 | Отсутствует |
| Mac OS X 10.4 (Intel) DMG-архив |
Скачать вер.1.10.3 | Отсутствует |
| Power Macintosh (PowerPC) DMG-архив |
Скачать вер.1.10.3 | Отсутствует |