UGENE home page

Скачать UGENE и компоненты

Текущая версия UGENE: 1.31.1 (октябрь, 2018). См. краткое описание новой версии.

Рекомендованные пакеты UGENE

При наличии на компьютере доступа к Интернету рекомендуется использовать онлайн-инсталлятор UGENE.
Специальный мастер установки позволит установить необходимые компоненты UGENE, а также обновить их, когда выйдет новая версия программы.
Выберите пакет для вашей операционной системы:

Прочие пакеты UGENE

Данные пакеты подходят для офлайн-установки UGENE. Выберите необходимый пакет для вашей операционной системы ниже.
Доступны следующие типы пакетов:
  • Стандартный: содержит базовые модули UGENE, встроенные в саму программу («embedded») инструменты, примеры входных данных и др.
  • Полный: в дополнение к модулям из стандартного пакета содержит внешние («external») инструменты (включая большинство инструментов для анализа данных высокопроизводительного секвенирования (NGS). Рекомендуется использовать данный пакет в случае отсутствия на компьютере доступа к Интернету.
  • NGS: предназначен для анализа ChIP-Seq данных.
Установленный пакет может быть дополнен необходимыми инструментами и референсными данными (см.»Интегрированные инструменты» и «Референсные данные для NGS» ниже).
Обратите внимание, что количество типов оффлайн-пакетов сократится при выпуске следующей версии UGENE!

Windows

Помимо типов пакетов, указанных выше, для Windows поддерживается два способа поставки, не влияющих, однако, на содержащиеся модули:
  • Оффлайн-инсталлятор: предоставляет более полную интеграцию с операционной системой. Для установки такого пакета требуется наличие администраторских прав на компьютере.
  • Zip-архив: портативная версия программы, не требующая администраторских прав.
Для устаревших версий Windows доступна версия UGENE 1.29.
ОС / платформа + тип поставки Стандартный пакет Полный пакет NGS пакет
Windows 7+ (64-бит)
Оффлайн-инсталлятор
Скачать Скачать Отсутствует
Windows 7+ (64-бит)
Zip-архив
Скачать Скачать Скачать
Windows 7+ (32-бит)
Оффлайн-инсталлятор
Скачать Скачать Отсутствует
Windows 7+ (32-бит)
Zip-архив
Скачать Скачать Отсутствует
Windows XP/Vista (32-бит)
Zip-архив
Скачать 1.29 Скачать 1.29 Отсутствует

macOS

Для пользователей macOS UGENE поставляется в виде DMG-архива. Поддерживается версия ОС 10.7 и выше. Для более старых версий доступны старые версии UGENE.
ОС / платформа + тип поставки Стандартный пакет Полный пакет NGS пакет
macOS 10.7+ (64-бит)
DMG-архив
Скачать Скачать Скачать
Mac OS X 10.6 (64-бит)
DMG-архив
Скачать 1.18.0 Скачать 1.18.0 Отсутствует
Mac OS X 10.5 (32-бит)
DMG-архив
Скачать 1.18.0 Скачать 1.18.0 Отсутствует
Mac OS X 10.4 (Intel)
DMG-архив
Скачать 1.10.3 Отсутствует Отсутствует
Power Macintosh (PowerPC)
DMG-архив
Скачать 1.10.3 Отсутствует Отсутствует

Linux

На различных версиях Linux используйте универсальный пакет UGENE в виде TAR.GZ-архива. Также, UGENE интегрирован в дистрибутивы операционных систем Ubuntu и Fedora.
ОС / платформа + тип поставки Стандартный пакет Полный пакет NGS пакет
Linux (64-bit)
TAR.GZ-архив
Скачать Скачать Скачать
Linux (32-bit)
TAR.GZ-архив
Скачать Скачать Отсутствует
Ubuntu
PPA
См. инструкцию См. инструкцию Отсутствует
Fedora
Yum
Отсутствует См. инструкцию Отсутствует

Интегрированные инструменты

UGENE предоставляет графический интерфейс для множества биоинформационных инструментов. В зависимости от требуемого анализа данных и установленного пакета UGENE, может потребоваться дополнительная установка/конфигурация соответствующих инструментов:
  • Пакет внешних инструментов: пакет содержит внешние («external») инструменты, за исключением JRE и RScript. Данный пакет по умолчанию включен в онлайн-инсталлятор, а также полный и NGS пакеты. Скачанный пакет инструментов необходимо указать в настройках приложения.
  • Java Runtime Environment (JRE): хотя UGENE не является Java-приложением, несколько для нескольких интегрированных инструментов (например, FastQC, Trimmomatic) требуется установленная версия JRE 8 или выше.
  • RScript: R используется в UGENE инструментами для анализа ChIP-Seq данных.

Пакет внешних инструментов

Референсные данные для NGS

Для некоторых видов анализа данных высокопроизводительного секвенирования (таксономической классификации и ChIP-Seq) требуется наличие референсных данных (например, RefSeq-данные, таксономическая информация с NCBI и др.).
Рекомендуется использовать онлайн-инсталлятор для скачивания этих данных. Однако, можно также использовать ссылки для скачивания ниже. При этом потребуется дополнительная конфигурация установленного пакета. Убедитесь, что на компьютере достаточно дискового пространства.

Референсные данные для классификации метагеномных NGS-данных

Референсные данные для анализа ChIP-Seq данных

Исходный код

UGENE является свободным программным обеспечением, распространяемым с лицензией GNU GPL v2. Исходный код доступен на GitHub.

Еженедельные сборки

Используйте следующие ссылки для скачивания текущей разрабатываемой версии программы (выкладываются еженедельно, соответствуют стандартному типу пакета).