UGENE home page

Скачать UGENE и компоненты

Текущая версия UGENE: 35.0 (июнь, 2020). См. краткое описание новой версии.

Рекомендованные пакеты UGENE — онлайн-инсталляция

При наличии на компьютере доступа к Интернету рекомендуется использовать онлайн-инсталлятор UGENE.
Специальный мастер установки позволит установить необходимые компоненты UGENE, а также обновить их, когда выйдет новая версия программы.
Выберите пакет для вашей операционной системы:
См. также инструкцию по установке пакетов (на английском языке).

Офлайн-инсталляция UGENE

Данные пакеты подходят для офлайн-установки UGENE, при этом может потребоваться дополнительная конфигурация.
Выберите пакет для вашей операционной системы:

Интегрированные инструменты

UGENE предоставляет графический интерфейс для множества биоинформационных инструментов. В зависимости от требуемого анализа данных и установленного пакета UGENE, может потребоваться дополнительная установка/конфигурация соответствующих инструментов:
  • Пакет внешних инструментов: пакет содержит внешние («external») инструменты, за исключением JRE и RScript. Данный пакет по умолчанию включен в онлайн-инсталлятор, а также полный и NGS пакеты. Скачанный пакет инструментов необходимо указать в настройках приложения.
  • Java Runtime Environment (JRE): хотя UGENE не является Java-приложением, несколько для нескольких интегрированных инструментов (например, FastQC, Trimmomatic) требуется установленная версия JRE 8 или выше.
  • RScript: R используется в UGENE инструментами для анализа ChIP-Seq данных.

Пакет внешних инструментов

Референсные данные для NGS

Для некоторых видов анализа данных высокопроизводительного секвенирования (таксономической классификации и ChIP-Seq) требуется наличие референсных данных (например, RefSeq-данные, таксономическая информация с NCBI и др.).
Рекомендуется использовать онлайн-инсталлятор для скачивания этих данных. Однако, можно также использовать ссылки для скачивания ниже. При этом потребуется дополнительная конфигурация установленного пакета. Убедитесь, что на компьютере достаточно дискового пространства.

Референсные данные для классификации метагеномных NGS-данных

Референсные данные для анализа ChIP-Seq данных

Исходный код

UGENE является свободным программным обеспечением, распространяемым с лицензией GNU GPL v2. Исходный код доступен на GitHub.

Старые пакеты UGENE

До версии UGENE 34 выпускались следующие типы пакетов:
  • Стандартный: содержит базовые модули UGENE, встроенные в саму программу («embedded») инструменты, примеры входных данных и др.
  • Полный: в дополнение к модулям из стандартного пакета содержит внешние («external») инструменты (включая большинство инструментов для анализа данных высокопроизводительного секвенирования (NGS). Рекомендуется использовать данный пакет в случае отсутствия на компьютере доступа к Интернету.
  • NGS: предназначен для анализа ChIP-Seq данных.
Начиная с версии 34 поставляются по одному онлайн и одному офлайн пакету для 64-битных версий операционных систем (см. выше).
Старые пакеты версии 33 доступны для скачивания ниже. Также доступны пакеты других версий для устаревших операционных систем.

Windows

Помимо типов пакетов, указанных выше, для Windows поддерживается два способа поставки, не влияющих, однако, на содержащиеся модули:
  • Оффлайн-инсталлятор: предоставляет более полную интеграцию с операционной системой.
  • Zip-архив: портативная версия программы, не требующая администраторских прав.
ОС / платформа + тип поставки Стандартный пакет Полный пакет NGS пакет
Windows 7+ (64-бит)
Оффлайн-инсталлятор
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Отсутствует
Windows 7+ (64-бит)
Zip-архив
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Скачать вер.33
Windows 7+ (32-бит)
Оффлайн-инсталлятор
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Отсутствует
Windows 7+ (32-бит)
Zip-архив
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Отсутствует
Windows XP/Vista (32-бит)
Zip-архив
Скачать вер.1.29 Скачать вер.1.29 Отсутствует

Linux

На различных версиях Linux используйте универсальный пакет UGENE в виде TAR.GZ-архива.
ОС / платформа + тип поставки Стандартный пакет Полный пакет NGS пакет
Linux (64-bit)
TAR.GZ-архив
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Скачать вер.33
Linux (32-bit)
TAR.GZ-архив
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Отсутствует

macOS

Для пользователей macOS UGENE поставляется в виде DMG-архива.
ОС / платформа + тип поставки Стандартный пакет Полный пакет NGS пакет
macOS 10.7+ (64-бит)
DMG-архив
Скачать вер.33 Скачать вер.33 Скачать вер.33
Mac OS X 10.6 (64-бит)
DMG-архив
Скачать вер.1.18.0 Скачать вер.1.18.0 Отсутствует
Mac OS X 10.5 (32-бит)
DMG-архив
Скачать вер.1.18.0 Скачать вер.1.18.0 Отсутствует
Mac OS X 10.4 (Intel)
DMG-архив
Скачать вер.1.10.3 Отсутствует Отсутствует
Power Macintosh (PowerPC)
DMG-архив
Скачать вер.1.10.3 Отсутствует Отсутствует

Пакеты внешних инструментов для UGENE версии 33