UGENE ve bileşenlerini indirin
Şu anki kararlı sürüm 51.0 (September, 2024).
Bakınız sürüm notları.
UGENE Paketleri
Dahil edilen harici araçlarla birlikte eksiksiz UGENE paketleri.
- Windows 64-bit için UGENE Yükleyici
- Windows 64-bit için UGENE Taşınabilir Paket
- Linux 64-bit için UGENE Taşınabilir Paket
- macOS için UGENE Paketi
NGS için Referans Verileri
Bazı NGS veri analizlerini (taksonomi sınıflandırması veya ChIP-Seq) çalıştırmak için referans verilerinin (örn.
RefSeq veritabanları, NCBI sınıflandırma dosyaları vb.).
Bu verileri indirmek için Çevrimiçi Yükleyiciyi kullanmanız önerilir, ancak aşağıdaki indirme bağlantılarını da kullanabilir ve
paketleri manuel olarak yapılandırabilirsiniz..
Hedef bilgisayarda yeterli disk alanı olduğundan emin olun.
NGS metagenomik sınıflandırması için veriler
- NCBI taksonomi sınıflandırması
- NCBI RefSeq bakteri genomları
- NCBI RefSeq viral genomları
- NCBI RefSeq GRCh38 insan genomu
- Kraken DB: MiniKraken 4Gb veritabanı
- CLARK-l DB: RefSeq bakteriyel+viral genomlar
- CLARK-l DB: RefSeq viral genomları
- DIAMOND DB: UniRef50
- DIAMOND DB: UniRef90
- MetaPhlAn2 gömülü DB: mpa_v20_m200
ChIP-Seq analizi için veriler
Kaynak kodu
UGENE, GNU GPL v2 lisansına sahip açık kaynaklı bir yazılımdır. Kaynak kod
GitHub da mevcuttur.
Eski UGENE Paketleri
UGENE sürüm 34'ten önce aşağıdaki paketler sağlanıyordu:
- Tam Paket: UGENE ana yürütülebilir dosyaları, harici araçlar (NGS veri analizi için araçlar dahil).
- NGS Paketleri: Tam Paket + ChIP-Seq veri analizi eklemeleriyle aynı (RScript, referans verileri)
34 sürümünden bu yana, 64 bit işletim sistemi başına yalnızca bir çevrimiçi ve bir çevrimdışı paket kaldı (yukarıya bakın).
UGENE sürüm 33'ün eski paketleri aşağıda mevcuttur. Ayrıca İşletim sistemlerinin eski sürümleri için daha eski paketler de vardır.
Windows
Yukarıda belirtilen türlerin yanı sıra, UGENE v.33'te aşağıdaki paket teslimat seçenekleri mevcuttu (bunun
teslimat türü bir paket içeriğini etkilemez):
- Çevrimdışı yükleyici: Windows ile daha yakın entegrasyon sağlar
- Zip arşivi: taşınabilir bir sürüm, yönetici hakları gerektirmez
| İşletim Sistemi/Platform + Dağıtım Türü | Fam Paket | NGS Paketi |
|---|---|---|
| Windows 7+ (64-bit) Çevrimdışı yükleyici |
v.33'ü indirin | N/A |
| Windows 7+ (64-bit) Zip arşivi |
v.33'ü indirin | v.33'ü indirin |
| Windows 7+ (32-bit) Çevrimdışı yükleyici |
v.33'ü indirin | N/A |
| Windows 7+ (32-bit) Zip arşivi |
v.33'ü indirin | N/A |
| Windows XP/Vista (32-bit) Zip arşivi |
v.1.29'u indirin | N/A |
Linux
Farklı Linux sürümleri için evrensel UGENE dağıtım türü TAR.GZ arşivi.
| İşletim Sistemi/Platform + Dağıtım Türü | Full Paket | NGS Paketi |
|---|---|---|
| Linux (64-bit) TAR.GZ arşivi |
v.33'ü indirin | v.33'ü indirin |
| Linux (32-bit) TAR.GZ arşivi |
v.33'ü indirin | N/A |
macOS
macOS'taki UGENE paket türü bir DMG yükleyicisidir.
| İşletim Sistemi/Platform + Dağıtım Türü | Full Paket | NGS Paketi |
|---|---|---|
| macOS 10.7+ (64-bit) DMG yükleyicisi |
v.33'ü indirin | v.33'ü indirin |
| Mac OS X 10.6 (64-bit) DMG yükleyicisi |
v.1.18.0'ı indirin | N/A |
| Mac OS X 10.5 (32-bit) DMG yükleyicisi |
v.1.18.0'ı indirin | N/A |
| Mac OS X 10.4 (Intel) DMG yükleyicisi |
v.1.10.3'ü indirin | N/A |
| Power Macintosh (PowerPC) DMG yükleyicisi |
v.1.10.3'ü indirin | N/A |